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Imagen Preclínica

ReDIB ofrece servicios de imagen preclínica en sus dos nodos. La Plataforma de Imagen Molecular y Funcional de CIC biomaGUNE dispone de dos equipos de imagen por resonancia magnética (MRI), equipos híbridos PET-CT y SPECT-CT y un equipo de imagen óptica-RX. La Infraestructura de Imagen Traslacional Avanzada (TRIMA) dispone de equipos de MRI, imagen híbrida PET-CT, tomografía molecular fluorescente (FMT) y un equipo de tomografía por fluorescencia y luminiscencia.

Pueden ser clasificados de acuerdo a sus aplicaciones en:

  1. Imagen avanzada (desde células individuales a animales)
  • Imagen nuclear
  • Resonancia magnética
  • Imagen in vivo en 3D y sistema de fluorescencia

    2.  Imagen molecular y funcional (desde moléculas individuales a pequeños organismos)

  • Espectroscopía óptica y microscopía
  • Nanoscopía

    3.  High throughput / Content Imaging (desde células a organismos)

3D IVIS Perkin Elmer 200

Alta sensibilidad y un bajo nivel de ruido para visualización y monitorización de actividad celular y genética en animales pequeños in vivo y en tiempo real. Permite marcaje de genes, células o tejidos.Localización: CNIC

FMT Perkin Elmer

Permite cuantificar un amplio número de biomarcadores, vías mecanísticas y niveles de respuesta terapéutica traslacional. Opera cerca de IR y es compatible con anestesia estándar.Localización: CNIC

Ambos nodos ofrecen instrumentación para la realización de estudios híbridos de imagen. La Plataforma de Imagen Molecular y Funcional de CIC biomaGUNE dispone de un equipo híbrido PET-CT y un equipo SPECT-CT dotado de anillo completo, que ofrece la posibilidad de efectuar estudios multi-isotópicos con discriminación energética. La Infraestructura de Imagen Traslacional Avanzada (TRIMA) dispone de un equipo de imagen híbrida PET-CT. Los dos nodos están dotados de quirófanos para la preparación/estabulado de los animales y una amplia variedad de equipos auxiliares: sistemas de anestesia, equipos de monitorización fisiológica, bombas de infusión, sistemas de termostatación, etc.

PET-CT (eXplore Vista-CT)

FOV axial de 5 cm; FOV transaxial de 7cm.
Movimiento de camilla controlado remotamente en imagen de cuerpo completo.
Reconstrucción mediante FBP, 2DOSEM y 3DOSEM.
Adquisición estática o dinámica, multi-cama y en modo lista.Localización: CIC biomaGUNE

SPECT-CT (eXplore speCZT CT 120)

FOV axial de 8 cm; FOV transaxial de 7.6 cm (rata) y 3.2 cm (ratón).
Anillo completo de detectores sólidos (10 cabezales) y colimadores cilíndricos intercambiables.
Alta resolución energética: detección simultánea de varios isótopos.Localización: CIC biomaGUNE

NanoPET-CT (Mediso)

Ofrece varias posibilidades de investigación, como la cuantificación de la biodistribución de isótopos emisores de positrones o la evaluación de nuevos biomarcadores para diagnóstico y tratamiento de enfermedades cardiovasculares.Localización: CNIC

Autorradiografía

Se utiliza para determinar la distribución del radiotrazador en los tejidos/órganos de interés o incluso de secciones de todo el cuerpo mediante la exposición de la muestra a una matriz de captura de energía.Localización: CIC biomaGUNE

Cámara MicroPET Albira PET-CT, Bruker

Sistema PET provisto de dos anillos formados por “8 LYSO high density scintillator glass modules”, capaces de proporcionar FOV transaxiales de 80mm, con resolución espacial de 1.5 mm (FWHM) y resolución temporal de 5 ns. Algoritmos de reconstrucción MLEM y OSEM.
Sistema CT provisto de fuente de rayos X Apogee 5000 (Oxford Instruments), 0-50 kV / 50 W, y detector de rayos X Flat Panel C7942 (Hamatsu Photonics).Localización: BioImaC

Ambos nodos ofrecen la instrumentación y los conocimientos necesarios para llevar a cabo un amplio espectro de estudios de imagen y espectroscopía de resonancia magnética aplicados a muestras biológicas que incluyen pequeños animales (ratas, ratones), muestras o extractos de tejido y cultivos celulares. Las instalaciones incluyen quirófanos equipados para la preparación de los animales para los exámenes de resonancia magnética y la implementación de modelos quirúrgicos, así como una amplia variedad de equipos auxiliares: sistemas de anestesia, equipos de monitorización fisiológica compatibles con RM, bombas de infusión, sistemas de termostatación, etc.

MRI 7T/30 cm (70/30 USR)

Dispone de dos gradientes: uno de 20 cm (200 mT/m) y otro de 12 cm (400 mT/m). Dispone de dos canales de transmisión de banda ancha y 4 canales de recepción en paralelo. Gran variedad de bovinas.Localización: CIC biomaGUNE

MRI 11.7T/16 cm (117/16 USR)

Gradiente de alto rendimiento de 9 cm (750 mT/m); 4 canales de transmisión de banda ancha y recepción en paralelo de hasta de 8 canales. Variedad de bovinas (detección de núcleos como 13C, 19F y 31P).

Localización: CIC biomaGUNE

7T MRI Agilent-Varian

Equipado con dos gradientes, una mayor de 21 cm con una potencia de gradiente máxima de 200mT/m y otro de 12 cm con una potencia de gradiente máxima de 400mT/m. Ideado para el estudio de animal pequeño (31 cm en horizontal).Localización: CNIC

Equipo de RM de 3T Philips Achieva TX (multitransmisión) release 5

Equipo con 60 cm de túnel central donde se llevan a cabo las adquisiciones avanzadas de RM con posibilidad de programación de secuencias de pulso especiales. Dispone de múltiples bobinas para animales pequeños y grandes, así como voluntarios y pacientes, con alta resolución espacial y temporal.Localización: PREBI-GIBI230

Equipo de Fluoroscopía digital Philips Veradius

Para estudios radiográficos y fluoroscópicos con posibilidad de angiografía. Para estudios preclínicos e in-vitro, así como para simulación y formación con dispositivos para especialistasLocalización: PREBI-GIBI230

Resonancia magnética (Philips Panorama 0.23T)

Equipado con un imán permanente de diseño abierto en C, que permite trabajar con animales de gran tamaño (cuerpo entero hasta 120kg y cabeza o extremidades de peso superior a 120kg). Cuenta con 2 bobinas de superficie y 4 bobinas convencionales de rodilla, cabeza, cuerpo y cuerpo XL.Localización: BioImaC

Benchtop MRI 1.0 T para pequeños roedores Bruker ICON 1 Tesla

Equipado con un imán permanente de 1 Tesla, un sistema de gradientes con una intensidad máxima de 450 mT/m y sondas de RF de diferentes tamaños para rata y ratón. Disponible para uso en modalidad autoservicio.Localización: BioImaC

MRI 4.7 T/40 cm Bruker BIOSPEC BMT 47/40

Equipado con tres sistemas de gradientes: a) 50 mT/m - 20 cm diámetro; b) 200 mT/m – 12 cm diámetro; c) 450 mT/m – 6 cm diámetro. Además el sistema está dotado con sondas de radiofrecuencia de diferentes formas y tamaños para diferentes núcleos (1H, 19F, 31P y 13C).

Localización: BioImaC

Ofrece un amplio rango de técnicas para la caracterización de biomateriales y biosuperficies. A destacar el estudio del desarrollo de nanopartículas biofuncionales y biomateriales así como su interacción con sistemas biológicos a nivel molecular. Por tanto, además del análisis de muestras, la plataforma también trabaja en la investigación de la interacción de nanomateriales con células vivas y tejidos, aportando información complementaria a otras técnicas de imagen in vivo y ex vivo

 

Microscopio Confocal (Zeiss LSM 880)

Microscopio confocal de fluorescencia equipado con: 405, láser de Argón (458, 488, 514), DPSS 561, 590 y HeNE 633. Las mediciones de FCS y FCCS se llevan a cabo utilizando detectores GaASP y PMTr para detección de moléculas de fluorescencia simple y caracterización dinámica. El microscopio puede estar equipado para imágenes de células vivas para control de temperatura y atmósfera.Localización: CIC biomaGUNE

Citómetro de flujo (BD FACS Canto II)

A través de la dispersión de la luz y la detección de emisión multicolor permite la caracterización físico/química de las células y micropartículas, detectando 8 colores a la vez. La óptica consiste en una fuente de excitación de hasta tres láseres (488, 633 y 405 nm).Localización: CIC biomaGUNE

Microscopio Confocal Raman (Renishaw inViaReflex)

El microscopio Renishaw in Via recoge espectros Raman en modo de confocalidad estándar o alta, dando lugar a una alta resolución espacial (<1μm lateral). Esta elevada capacidad puede ser utilizada para crear mapas de la composición química de las zonas o volúmenes en la muestra.Localización: CIC biomaGUNE

Microscopio Cell Observer (Zeiss Axio observer)

Permite el análisis cuantitativo y cualitativo de procesos tanto rápidos como lentos de células vivas bajo condiciones biológicas. Dispone de una lámpara Xenón y 4 LEDs con 4 longitudes de onda (365, 470, 530, 590 nm) para epifluorescencia que combinan con iluminación de transmisión y una plataforma motorizada. Apto para experimentos de larga duración.Localización: CIC biomaGUNE

Microscopio Scanning Confocal (Zeiss LSM 510)

Obtención de imágenes multicolor (hasta 8 colores) con alta sensibilidad y reducido fondo para unas reconstrucciones en 3D. Provisto de un módulo de FCS y FLIM para estudios de dinámica e interacción de moléculas individuales. También módulos de análisis FRAP y FRET para estudiar procesos de difusión e interacciones a nivel molecular.Localización: CIC biomaGUNE

Las técnicas incluidas en la Plataforma de Nanoscopía son herramientas excelentes para la caracterización molecular de biomoléculas en una fase temprana y el análisis ultraestructural de orgánulos subcelulares usando marcadores de fluorescencia multicolor.

Dependiendo del tipo de método usado, es posible mejorar la máxima resolución basada en imágenes desde 200 nm a 20-100 nm. Hasta ahora, estructuras subcelulares pequeñas no resolubles como centriolos, acumulaciones lipídicas, espinas de dendritas neuronales, complejos de poros nucleares, complejos polares de bacterias, y muchas otras estructuras macromoleculares con menos de 200 nm en dimensiones Y, X- de momento solo accesibles mediante microscopía electrónica- pueden ser visualizadas por microscopía óptica multicolor y finalmente por imagen de células vivas.

Leica 3-Colour Fast Total Internal Reflection Fluorescence (TIRF) DMI 6000

Iluminación TIRF para la visualización selectiva de estructuras estrechas tales como la membrana celular basal para estudios de movilidad celular, agregación de proteínas, tráfico de vesículas, etc. La resolución en la dirección Z llega hasta 70 nm.Localización: CNIC

Leica Single Molecule Localization by Ground-State Depletion (dSTORM)

Sistema flexible basado en técnicas estándar de immunotinciones que combina TIRF y epifluorescencia con imagen de moléculas individuales (max resolución lateral 20 nm). Localización de moléculas individuales (plano y, x) y en muestras de células fijadas.Localización: CNIC

Leica gated-STED-3X – WWL SP8 Super‐resolution

Microscopio Gated Stimulated Emission Depletion (STED) para la toma de imágenes 3D en dos colores en muestras pequeñas y fijas a una máxima resolución de 20 nm (x,y) y 80 nm (z) con una mejora en la resolución espacial desde 5 a 10 veces con respecto a microscopios confocales convencionales.Localización: CNIC

Este área está localizada en el CNIC. Está compuesta por la técnica de análisis celular High Content Screening (HCS) y apoya cuantitativamente a la investigación basada en high throughput image.

El desarrollo de la aplicación de análisis de imagen incluye High Content Screening, modelaje 3D y 4D, registro de imagen, métodos Computer Vision, análisis de imagen en 2D y 3D y segmentación y Machine learning.

Está equipada con paquetes de software de análisis de imagen (Acapella, Definies, MatLab, MetaMorph, Imaris, Volocity) y desarrollo de algoritmos personalizados para el análisis de imagen.

HCS Imaging resources

Imagen de alto rendimiento (High throughput imaging): microscopio automático confocal para la lectura de microplacas (Opera, Perkin Elmer) equipado con un distribuidor de placas con estantes de 14 posiciones y lector de código de barras.Localización: CNIC

Robot de manejo de líquidos Tecan

La plataforma se conecta a un incubador apto para 110 placas (Freedom EVO, Tecan) y un carrusel de almacenamiento (hasta 220 microplates). Incluye un contador celular (Coulter) y un sembrador celular (Multidrop, Thermo).Localización: CNIC

Quirófano de grandes animales

Equipado con sistema de poleas para movilizar animales de gran tamaño, camilla acolchada adaptada para caballos y equipo de anestesia adaptado para grandes animales.Localización: BioImaC

Quirófano de pequeños animales

Quirófano adaptado para intervenciones quirúrgicas de pequeños animales, equipado con aparato de anestesia.Localización: BioImaC

Salas de estabulación de animal grande

Atendida por personal técnico para la supervisión diaria y regular del estado de los animales estabulados.Localización: BioImaC

Salas de estabulación de animal pequeño

Atendida por personal técnico para la supervisión diaria y regular del estado de los animales estabulados.Localización: BioImaC

Espectrómetro RMN 500 MHz de Bruker

Equipado, entre otras, con sonda HR-MAS de triple núcleo (1H, 13C, 31P), para el estudio espectroscópico directo de muestras semisólidas, como tejidos biológicos intactos y muestras tisulares procedentes de biopsias.

Localización: BioImaC

Ecógrafo (Philips SD11)

Equipado con 2 sondas, una convexa de 3.5-8MHz y una lineal de 7.5-12 MHz. Especialmente dedicado a ecografía abdominal, torácica no cardiaca, musculoesquelético, cuello y partes blandas superficialesLocalización: BioImaC

Ecógrafo (Philips Affiniti 50)

Equipado con 2 sondas sectoriales, una 2-4MHz y otra de 12MHz. Especialmente configurado para ecografía cardiaca.Localización: BioImaC

Equipo de rayos para pequeños animales (SedecalVet)

Equipado con un tubo de rayos X 500mA -125kV y mesa de 200cm de longitud. Cuenta con sistema de digitalización CR (Agfa CR X-30) provisto de chasis de diversos tamaños (máximo 40x43cm).Localización: BioImaC

Equipo de rayos para pequeños animales (SedecalVet)

Equipado con un tubo de rayos X 400mA -125kV y mesa de 150cm de longitud. Cuenta con sistema de digitalización DR (Perkin Elmer XRPad 4336) con panel de 43x43cm.Localización: BioImaC

Laboratorio de imágenes computacionales biomédicas

Laboratorio de imágenes computacionales biomédicas con servidores de computación de alto rendimiento (HPC) equipados con tarjetas de unidad de procesamiento de gráficos (GPU) Tesla K-40. También soluciones avanzadas de software de biomarcadores radiológicos y de imágenes.Localización: PREBI-GIBI230

Equipo de rayos X para grandes animales (Philips Super 100CP)

Equipado con un tubo de rayos X 650mA -150kV. Tubo y bucky suspendidos en sistema de railes para la realización de proyecciones radiográficas en cualquier dirección.Localización: BioImaC

Equipo multimodal de micro-PET/TC Bruker Albira

Con 3 anillos PET y detectores TC planares que permiten adquisiciones de TC y PET de alta resolución, óptima en preclínica para pequeño animal y estudios in-vitro. La parte PET con 3 anillos adquiere con una resolución espacial de 1 mm; mientras que la TC genera imágenes de alta resolución de hasta 90 micras de resolución espacial.Localización: PREBI-GIBI230

Fluoroscopio analógico (Philips)

Medio arco en C analógico que permite realizar procedimientos radiológicos guiados por fluoroscopia en sala o en quirófano.Localización: BioImaC